Orbitrap Ascend Editions三合一質(zhì)譜儀是一款革命性整合了多種碎裂和反應(yīng)技術(shù)的創(chuàng)新平臺。它通過單一系統(tǒng)實現(xiàn)數(shù)據(jù)互補(bǔ)，極大簡化了工作流程，提升了分析效率與深度。該儀器顯著提升了在多組學(xué)研究中的覆蓋范圍，能夠加速生物制藥領(lǐng)域的藥物開發(fā)和質(zhì)控分析，并為解析復(fù)雜蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)等前沿生命科學(xué)問題提供*助力。
在更新的4.3版本軟件中，針對數(shù)據(jù)質(zhì)量控制、智能數(shù)據(jù)采集、電子轉(zhuǎn)移裂解ETD、寡核苷酸分析等方向都進(jìn)行了多項升級，可顯著提升多組學(xué)、生物制藥及結(jié)構(gòu)生物學(xué)分析效能。
新增：實時數(shù)據(jù)質(zhì)量控制 Real-Time Quality Control, RT-QC
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方法編輯器中新增了一個過濾功能，Real-Time QC，用戶可設(shè)定鑒定肽段數(shù)的上限或下限。數(shù)據(jù)采集過程中，進(jìn)行實時檢索，若結(jié)果未滿足設(shè)定標(biāo)準(zhǔn)，Xcalibur序列將自動暫停，以便用戶檢查可能的原因，避免浪費(fèi)剩下的樣品。
新增：自適應(yīng)保留時間Adaptive RT
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自適應(yīng)保留時間功能可根據(jù)采集的參考譜圖文件對被分析物的保留時間進(jìn)行自動調(diào)節(jié)，可減少缺失值，且縮小靶標(biāo)定量分析的保留時間窗口，有效提高分析通量。可用于PRM定量或者SQUAD及hybridDIA方法。
另外，AdaptiveRT的加入可更好地實現(xiàn)在一套系統(tǒng)中完成從發(fā)現(xiàn)到靶標(biāo)分析的完整流程。
新增：HybridDIA
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HybridDIA 方法在同一針進(jìn)樣中結(jié)合非靶標(biāo)的DIA分析和基于靶標(biāo)的tMS2分析，可同時進(jìn)行發(fā)現(xiàn)型的DIA和靶標(biāo)定量，適用于在非靶標(biāo)分析的同時重點(diǎn)關(guān)注特定的靶標(biāo)對象。
在Ascend儀器中，因為同時有orbitrap和離子阱質(zhì)量分析器，可更好地實現(xiàn)并行分析，使用Orbitrap進(jìn)行 DIA掃描并使用離子阱進(jìn)行靶向的MS2掃描，在不損失DIA深度覆蓋性能的同時實現(xiàn)特定靶標(biāo)的高靈敏度高通量定量。
更新：實時檢索RTS
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RTS SPS MS3方法在TMT實驗中可顯著提高定量準(zhǔn)確性，新增的信噪比閾值過濾可進(jìn)一步提高定量可信度。
當(dāng)啟用實時檢索(RTS)，在TMT SPS MS3模式下開啟Closeout功能時，界面將顯示新增的"MS3信噪比閾值"選項，可進(jìn)行自定義。通過實時搜索鑒定的MS2譜圖若生成質(zhì)量較差的MS3譜圖，將不再計入對應(yīng)蛋白質(zhì)的定量數(shù)值，更有助于提高定量準(zhǔn)確性。
更新：實時譜庫檢索RTLS
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實時庫搜索(RTLS)可實現(xiàn)數(shù)據(jù)庫中相似化合物的智能采集。小分子分析模式下，新增的Modified Cosine Similarity在對比實驗譜圖與庫譜圖時，會同時考慮母離子之間的質(zhì)量偏差，并據(jù)此對碎片離子的質(zhì)荷比進(jìn)行校正，從而更精確地計算相似性。
使用更新后的RTLS，無需人工干預(yù)，通過庫搜索可自動發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)相關(guān)化合物。且由于匹配得分更高，能在未知樣品中發(fā)現(xiàn)更多可匹配的化合物。
更新：更快速的ETD 反應(yīng)時間
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ETD碎裂在多種不同的研究領(lǐng)域都有重要應(yīng)用，包括糖基化修飾、二硫鍵、從頭測序、top-down，middle-down分析等等。其中，ETD反應(yīng)時間是一個非常重要的參數(shù)，影響碎裂效率、整體的循環(huán)時間等。
更新之后，離子阱中的ETD反應(yīng)時間縮短，更接近離子注入時間，可實現(xiàn)更優(yōu)的并行化效率。
新增：HDX 校正設(shè)置
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在氫氘交換質(zhì)譜分析中，ETD方法能夠顯著提升分辨率，可從肽段水平精確至單個氨基酸殘基水平，這對于表位分析等需要精確定位結(jié)合位點(diǎn)的應(yīng)用尤為重要。
其中，最小化 scrambling 至關(guān)重要。新增的 HDX 校正功能可一鍵設(shè)置后自動調(diào)節(jié)儀器參數(shù)，實現(xiàn)更溫和的離子傳輸，降低 HDX-ETD 實驗中的氫氘 scrambling，獲得更精準(zhǔn)的相互作用位點(diǎn)定位。
新增：寡核苷酸模式
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目前的寡核苷酸分析中面臨多重挑戰(zhàn)：
● 譜圖復(fù)雜度高
● 存在大量同質(zhì)異位碎片離子
● 產(chǎn)生難以解析的內(nèi)部碎片
新增的寡核苷酸模式中，采用低 Mathieu q值CID技術(shù)，并對其進(jìn)行校正，可有效降低二級譜圖的復(fù)雜程度，提高寡核苷酸分析的序列覆蓋度。用戶可通過調(diào)用寡核苷酸表征的方法模版進(jìn)行操作，簡便易用。
本次Orbitrap Ascend Editions三合一質(zhì)譜儀的多項升級，通過將更智能的實時采集控制、更快速的ETD反應(yīng)，以及專為蛋白高級結(jié)構(gòu)，寡核苷酸等復(fù)雜表征設(shè)計的解決方案融為一體，該平臺成功將多組學(xué)研究的覆蓋范圍、生物制藥開發(fā)的穩(wěn)健性，以及結(jié)構(gòu)生物學(xué)的解析精度推向新的高度。
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