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圣裘德兒童研究醫(yī)院和德國癌癥研究中心研究者為首的團隊利用分子診斷的方法，已經(jīng)確定了四個疑似中樞神經(jīng)系統(tǒng)原始神經(jīng)外胚層瘤(CNS-PNET)的新亞型。
CNS-PNETs起因于中樞神經(jīng)系統(tǒng)中不成熟和未分化的組織。這些腫瘤非常罕見且具有侵襲性，并且患病的大多數(shù)是兒童。雖然它們只占兒童腦瘤的一小部分，但根據(jù)NIH的統(tǒng)計結(jié)果，被診斷患有CNS-PNET腫瘤的兒童的五年生存期只有40%~60%。
圣裘德神經(jīng)病理學家，文章*作者Brent Orr說，群體數(shù)量太少是研究罕見癌癥和疾病的一大難點。雖然CNS-PNETs在范圍內(nèi)的發(fā)病率非常低，但是這項研究的性質(zhì)能夠確保我們有足夠的群體數(shù)量來進行研究。
Orr說，診斷和治療CNS-PNETs難點是，很難將它們與神經(jīng)膠質(zhì)瘤區(qū)分開，這對確定患者zui有效的治療方法是非常重要的，因為CNS-PNETs通常利用全腦脊髓輻射進行治療，而神經(jīng)膠質(zhì)瘤通常利用局部放射療法進行治療。
在該項研究中，研究人員收集了歸類為CNS-PNET的323個腫瘤的組織，以及來自211枚被準確定義的參考腦瘤的組織，這些腦瘤是非 CNS-PNET類的。他們利用Illumina公司的Human-Methylation 450 BeadChip array對這兩組組織樣本進行了DNA甲基化分析。
根據(jù)甲基化分析的結(jié)果，研究團隊發(fā)現(xiàn)，61%的CNS-PNETs可以被重新歸類為一種不同類型的腦瘤，例如神經(jīng)膠質(zhì)瘤，室管膜瘤和非典型畸形樣瘤/橫紋肌樣瘤。在很多情況下，腫瘤的重新分類意味著一個*不同的治療方案。
其余的CNS-PNETs分析結(jié)果中，研究人員發(fā)現(xiàn)，大多數(shù)屬于四個不同亞組中的一組，并且每個都有*的基因變異，包括基因重排，刪除和擴增。
研究人員也分析和尋找樣本間的，來驗證甲基化分析結(jié)果與這四類CNS-PNET亞型其他遺傳特征的相關(guān)性。
他們也提取了組織樣本的DNA和RNA，并且利用Illumina公司的儀器對其進行測序，以便獲取這四種CNS-PNET亞型的更全面的基因理解，并揭示子群特定的突變。當研究人員分析基因表達數(shù)據(jù)時，他們發(fā)現(xiàn)了在腫瘤細胞中已被破壞的，其他種類子群特定的通路差異，這可以作為開發(fā)藥物的靶標。
研究人員也注意到，腫瘤亞型和治療效果也隨著病人的年齡和性別的不同而不同。他們相信，這表明該腫瘤可能會對不同的靶向治療有響應。
Orr說，“目前的挑戰(zhàn)是如何把這些分子診斷技術(shù)轉(zhuǎn)化到臨床應用上，它們目前并沒有在臨床上被驗證。”
然而，Orr和他的同事們也指出，他們已經(jīng)開始開展關(guān)于結(jié)合分子標記來定制臨床實驗應用于CNS-PNETs分類和診斷的工作。
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