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北京大學(xué)伊成器研究組發(fā)展了一種通過化學(xué)標(biāo)記和富集手段實(shí)現(xiàn)全轉(zhuǎn)錄組水平上假尿嘧啶RNA修飾的單堿基分辨率測序技術(shù)，并繪制了人和小鼠細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中假尿嘧啶RNA（信使核糖核酸）修飾的譜圖。相關(guān)成果日前發(fā)表于《自然—化學(xué)生物學(xué)》雜志。
轉(zhuǎn)錄后修飾在生命體中廣泛存在，假尿嘧啶RNA修飾就是其中的重要成員。假尿嘧啶在多種非編碼RNA上的功能與機(jī)制已有較多研究，但對(duì)于信使RNA（mRNA）上假尿嘧啶的分布和潛在生物學(xué)功能，目前知之甚少。zui主要的難題在于如何實(shí)現(xiàn)假尿嘧啶在mRNA上的定位。
為研究哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)錄組中的假尿嘧啶修飾，科學(xué)家首先利用高分辨質(zhì)譜對(duì)mRNA中的假尿嘧啶修飾進(jìn)行定量，發(fā)現(xiàn)其廣泛存在于各種細(xì)胞系及小鼠的組織中，并且在哺乳動(dòng)物mRNA中豐度相當(dāng)高?？蒲腥藛T繼而通過化學(xué)生物學(xué)、高通量測序等手段，發(fā)展了一種利用小分子化合物實(shí)現(xiàn)特異性標(biāo)記與富集的假尿嘧啶高通量測序技術(shù)。
利用該技術(shù)，他們實(shí)現(xiàn)了人細(xì)胞系以及小鼠（大腦與肝臟組織）全轉(zhuǎn)錄組水平的單堿基分辨率假尿嘧啶檢測，發(fā)現(xiàn)在數(shù)千個(gè)mRNA與長非編碼RNA上都含有假尿嘧啶修飾。
研究還發(fā)現(xiàn)，轉(zhuǎn)錄組中假尿嘧啶的含量與分布均受到各種環(huán)境刺激的調(diào)控，呈現(xiàn)出“刺激條件特異性"的誘導(dǎo)修飾。因此，此項(xiàng)研究不但揭示了假尿嘧啶的廣泛存在，繪制了轉(zhuǎn)錄組中假尿嘧啶RNA修飾的高清譜圖，也為這一轉(zhuǎn)錄后修飾參與基因表達(dá)調(diào)控的研究提供了重要工具，同時(shí)為近年來興起的RNA表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域提供了嶄新的研究方向。
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