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科諾美 Frontier 生物惰性液相,攻克寡核苷酸 ASO 分析瓶頸

來源:科諾美(北京)科技有限公司   2026年09月18日 09:51  

寡核苷酸藥物(Oligonucleotide Drugs)是一類以寡核苷酸為基礎(chǔ)的治療藥物,主要用于調(diào)節(jié)基因表達(dá)或干擾與疾病相關(guān)的RNA分子功能。其中,反義寡核苷酸(ASO)作為技術(shù)成熟、應(yīng)用廣泛的核酸藥物,全球年銷售額就達(dá)到約32億美元,成為基因治療領(lǐng)域的重要支柱。因此,對寡核苷酸進(jìn)行高靈敏度和穩(wěn)定的定性定量分析變得越來越重要。LC-MS/MS由于其優(yōu)異的選擇性和高靈敏度可為寡核苷酸定量分析提供有效幫助。然而ASO硫代骨架是強(qiáng)負(fù)電,大分子易金屬螯合,容易產(chǎn)生強(qiáng)非特異性吸附,導(dǎo)致LC-MS/MS殘留大,高濃度進(jìn)樣后,后續(xù)空白持續(xù)出峰。針對寡核苷酸藥物在色譜端殘留大的問題,科諾美推出Frontier生物惰性超高效液相色譜系統(tǒng)(Frontier Bio Inert LC),該系統(tǒng)與質(zhì)譜儀聯(lián)用,可以大大減少乃至消除非特異性吸附,有效提高檢測精準(zhǔn)度;無需鈍化處理系統(tǒng),提高儀器使用效率,為寡核苷酸藥物測定提供優(yōu)質(zhì)解決方案。





01
實(shí)驗(yàn)部分




儀器設(shè)備:Frontier Bio Inert LC 聯(lián)用 SCIEX 5500+ MS/MS
科諾美 Frontier 生物惰性液相,攻克寡核苷酸 ASO 分析瓶頸


色譜條件

液相方法:

色譜柱:KINETEX 2.6μm EVO C18 100? 50*2.1mm

流動相:A:水(0.15%DIEA+0.7%HFIP);

流動相:B:乙腈(0.15%DIEA+0.7%HFIP)

梯度洗脫:0.01-3.0min,5%B-30%B;3.0-5.0min,30%B-100%B;5.0-5.9min,100%B。

流速:0.3mL/min

柱溫:40℃

進(jìn)樣量:5μL


質(zhì)譜方法:

數(shù)據(jù)采集方法:MRM(多反應(yīng)監(jiān)測)

離子源:ESI負(fù)模式

氣簾氣CUR:35psi      IS電壓:5500V

源溫度TEM:550℃     霧化氣GS1:50psi

輔助氣GS2:50psi      碰撞氣CAD:high

表1 寡核苷酸(ASO)的MRM離子對信息

科諾美 Frontier 生物惰性液相,攻克寡核苷酸 ASO 分析瓶頸


02
實(shí)驗(yàn)結(jié)果

 

Carryover測試結(jié)果對比



按照空白-500ng/mL-空白1-空白2的進(jìn)樣順序編輯序列,運(yùn)行結(jié)束后根據(jù)目標(biāo)峰的峰面積計算500ng/mL濃度之后的第一針和第二針空白的殘留水平,結(jié)果如表2所示。 Bio inert系統(tǒng)新增多種自動進(jìn)樣器清洗方式,通過增加針清洗和閥清洗等方式殘留可降至0.1%以內(nèi)。

表2 生物惰性Frontier Bio Inert 不同進(jìn)樣器清洗程序儀器殘留對比表(以峰面積計算)

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科諾美 Frontier 生物惰性液相,攻克寡核苷酸 ASO 分析瓶頸

圖1 寡核苷酸的提取離子流圖(XIC)

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圖2 寡核苷酸(ID-1)500ng/mL以及空白1殘留圖

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圖3 寡核苷酸(ID-2)500ng/mL以及空白1殘留圖

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圖4 寡核苷酸(ID-3)500ng/mL以及空白1殘留圖

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圖5 寡核苷酸(ID-4)500ng/mL以及空白1殘留圖


線性




將適量寡核苷酸(ASO)用處理后的大鼠血清上清液稀釋成濃度為1.0ng/mL,5.0ng/mL,10.0ng/mL,50.0ng/mL,100.0ng/mL,200ng/mL,500ng/mL的標(biāo)準(zhǔn)工作液分別進(jìn)樣分析。寡核苷酸線性結(jié)果如圖4所示,在1.0ng/mL~500ng/mL范圍內(nèi)線性良好,r2均大于0.999。

科諾美 Frontier 生物惰性液相,攻克寡核苷酸 ASO 分析瓶頸

圖6 寡核苷酸(ASO)的標(biāo)準(zhǔn)曲線結(jié)果


重現(xiàn)性



將100ng/mL的寡核苷酸(ASO)樣品連續(xù)進(jìn)樣6次進(jìn)行重復(fù)性考察。保留時間重復(fù)性在0.24%-0.26%之間,峰面積重復(fù)性在0.84%-1.30%之間。(圖7-圖10)。

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圖7 寡核苷酸ASO(ID-1)100ng/mL連續(xù)6針重復(fù)性結(jié)果表

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圖8 寡核苷酸ASO(ID-2)100ng/mL連續(xù)6針重復(fù)性結(jié)果表

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圖9 寡核苷酸ASO(ID-3)100ng/mL連續(xù)6針重復(fù)性結(jié)果表

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圖10 寡核苷酸ASO(ID-4)100ng/mL連續(xù)6針重復(fù)性結(jié)果表


03
結(jié)論

本方案采用科諾美生物惰性超高效液相色譜系統(tǒng)Frontier Bio Inert LC,該系統(tǒng)與質(zhì)譜儀聯(lián)用,采用新的自動進(jìn)樣器清洗方式,有效降低寡核苷酸非特異性吸附,線性最高點(diǎn)500ng/mL后空白殘留在0.1%以內(nèi),在濃度范圍1ng/mL-500ng/mL內(nèi)線性良好,線性相關(guān)系數(shù)大于0.999,重復(fù)性好,滿足寡核苷酸藥物的精準(zhǔn)測定。



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