蛋白質(zhì)分析和鑒定方法常用的就是ELISA和Western Blot（以下簡(jiǎn)稱(chēng)WB）。

ELISA和WB都是基于抗原-抗體特異性結(jié)合的原理，主要區(qū)別在于：

ELISA對(duì)于抗原、抗體都能檢測(cè)。

WB則主要檢測(cè)抗原。

此外，了解這兩種方法的優(yōu)缺點(diǎn)，即可輕而易舉地解決如何選擇的問(wèn)題。

一、ELISA:

靈敏度高、應(yīng)用領(lǐng)域廣泛，檢測(cè)樣本濃度可低至pg/ml，操作相對(duì)簡(jiǎn)單，用于確定樣品中是否存在蛋白質(zhì)的高效方法，亦可精確定量蛋白質(zhì)的濃度。

ELISA 具有包被、封閉、檢測(cè)、 結(jié)果讀取4個(gè)常規(guī)操作步驟，有直接、間接、夾心及競(jìng)爭(zhēng)檢測(cè)4種主要類(lèi)型。

ELISA的優(yōu)缺點(diǎn)：

優(yōu)點(diǎn)：適合體液(血清、尿液等)、細(xì)胞上清樣本；靈敏度高，操作簡(jiǎn)單、高效、快速（1-2h），需樣品量較少，可以同時(shí)進(jìn)行多個(gè)樣本分析。另外，也可靈活地DIY 檢測(cè)試劑盒，即可降低成本，又解決了實(shí)驗(yàn)需求；同時(shí)ELISA可搭配實(shí)驗(yàn)室高通量或自動(dòng)化設(shè)備，實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化操作。

缺點(diǎn)：實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中，由于操作問(wèn)題、樣品污染、使用低質(zhì)量試劑等原因，其特異性方面經(jīng)常受到影響，可能會(huì)產(chǎn)生假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果；此外試劑盒中的抗體組分須低溫運(yùn)輸、儲(chǔ)存；ELISA無(wú)法提供有關(guān)目標(biāo)蛋白的質(zhì)量和豐度等其他信息。

二、Western Blot：

是一種通過(guò)電泳、轉(zhuǎn)膜、抗體孵育、成像等步驟對(duì)目標(biāo)蛋白進(jìn)行檢測(cè)的方法，操作流程相對(duì)復(fù)雜，用于識(shí)別和了解蛋白質(zhì)的一些特征元素、蛋白質(zhì)相互作用和修飾等，可提供目標(biāo)蛋白的詳細(xì)信息，如蛋白質(zhì)大小和豐度等，也常被用于ELISA和其他檢測(cè)方法結(jié)果的驗(yàn)證，它可以有效地幫助排除假陽(yáng)性或假陰性的結(jié)果。

Western Blot的優(yōu)缺點(diǎn)：

優(yōu)點(diǎn)：適用于組織或細(xì)胞裂解液樣本；檢測(cè)結(jié)果簡(jiǎn)單易懂；特異性高，能夠從多種蛋白質(zhì)中識(shí)別目標(biāo)蛋白；可提供目標(biāo)蛋白的分子量、表達(dá)豐度等信息；熒光Western Blot，可以在一個(gè)實(shí)驗(yàn)中進(jìn)行多重檢測(cè)，檢測(cè)多種蛋白質(zhì)。

缺點(diǎn)：傳統(tǒng)操作步驟繁瑣、耗時(shí)（1到2天），體系如果沒(méi)有優(yōu)化，容易出現(xiàn)信號(hào)衰減快、高背景等情況，導(dǎo)致不理想的檢測(cè)結(jié)果；同時(shí)檢測(cè)靶蛋白的數(shù)量受限于一抗和二抗的組合；通常被用作驗(yàn)證方法。

三、ELISA or Western Blot怎么選？

若實(shí)驗(yàn)?zāi)康氖切枰?jiǎn)單、快速地確定蛋白質(zhì)是否存在，并需要得到精確濃度，ELISA是更好的選擇。

若實(shí)驗(yàn)?zāi)康氖切枰玫礁嚓P(guān)于蛋白質(zhì)的信息，比如分子量、純度、蛋白質(zhì)間相互作用、蛋白質(zhì)表達(dá)變化或翻譯后修飾等，則Western Blot更適合。

此外，Western Blot和ELISA檢測(cè)的結(jié)果也可相互印證。