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一種非熒光發(fā)色團BHQ-3 NHS,871240-94-7

發(fā)布時間:2022-11-14
提 供 商 西安凱新生物科技有限公司 資料大小 16.6KB
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資料類型 JPG 圖片
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英文名稱:BHQ-3 NHS

CAS:871240-94-7

外觀:深紫色粉末

分子式:C37H38N7O4+

分子量:644.76

儲存條件:-20°C,避光避濕

結構式:


產品簡介:黑暗猝滅劑?-3染料寡核苷酸修飾。BHQ-3可以位于5或3末端或寡核苷酸的內部。BHQ?-3標記的寡核苷酸用于許多應用,包括用于實時PCR的雙標記熒光探針。該暗猝滅劑具有620-730 nm的強吸收范圍,可對在該范圍內發(fā)出熒光的熒光團(如Quasar?670和Quasar 705染料)進行猝滅。

NHS修飾是合成后與一個伯氨基的共軛,因此是一個附加的需要用氨基修飾。C6或C12氨基可置于5'或對于3'端,使用C3或C7氨基,對于內部位置,使用氨基修飾的堿,例如氨基dT C6?;贜HS的產率修飾是使用伯氨基進行的合成后共軛。與可作為酰胺的直接自動化偶聯改性相比,產率較低。近似各種規(guī)模的產量如下所示。

50 nmol規(guī)模合成的***終產量約為2 nmol。

200 nmol規(guī)模合成的~5 nmol***終產量。

1μmol規(guī)模合成的~16 nmol***終收率

黑洞猝滅劑-1(BHQ-1)被歸類為暗猝滅劑(一種非熒光發(fā)色團),被***使用作為各種熒光共振能量轉移(FRET)DNA檢測探針中的3'-猝滅部分。這樣的探針主要用于***分析,但也可用于***結構研究(1)。例子包括TaqMan探針(2)、蝎子引物(3)和分子信標(4)。BHQ-1的吸光度為534 nm,有效吸光度范圍為480-580 nm。這是用于與熒光染料配對的猝滅劑,熒光染料在可見光范圍(519-556 nm)的黃綠色到黃色部分發(fā)射。這個染料的發(fā)射光譜與BHQ-1的吸收光譜充分重疊,從而使后者能夠淬滅染料前者熒光***。

在FRET探針中使用暗猝滅器的優(yōu)點是低背景熒光(因此更好)信噪比,(b)更高的動態(tài)范圍,(c)適用于多重分析(由于暗猝滅器沒有二次熒光),以及(d)使用暗猝滅劑易于合成FRET探針(因為暗猝滅劑在低聚物脫保護步驟中抗降解)(5)。

作為***雜交探針檢測系統使用的各種熒光染料和猝滅劑分子的開發(fā)允許開發(fā)幾種不同的實時PCR分析系統,這些系統利用染料猝滅劑雜交探針,僅當它們與目標結合時才產生熒光信號。然而,為了正確設計針對特定目標的分析,重要的是根據分析中使用的雜交探針類型、待檢測的目標數量以及可用于執(zhí)行分析的設備類型,仔細選擇雜交探針的染料和猝滅劑。

1) 選擇能被激發(fā)源和你計劃在實驗中使用的分光光度熱循環(huán)儀的光學元件適當激發(fā)和檢測的熒光染料。基于激光的激發(fā)源通常在窄波長范圍內(例如,氬離子激光器為500-540 nm)提供激發(fā),而白光源(例如,鹵鎢燈)和發(fā)光二極管與激發(fā)和發(fā)射濾光片結合可在整個可見范圍(400-700 nm)內激發(fā)熒光團。

2) 對于用一個雜交探針檢測一個目標,建議對染料使用FAM、HEX或TET,因為它們可以在所有分光光度熱循環(huán)儀上檢測到,并且所有三種探針都可以使用磷酰胺(這使得探針的合成簡單且具有***效益)。

3) 對于復合分析,至少需要兩種不同的雜交探針,應選擇吸收和發(fā)射波長分離良好的染料。

4) 對于FRET雜交探針,應選擇光譜高度重疊的熒光染料猝滅劑對。請參閱淬火劑選擇表以選擇適當的淬火劑。

5) 對于基于接觸猝滅的雜交探針(例如,分子信標),任何非熒光猝滅劑都應工作良好。



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