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2'-OMe-pU-CE-Phosphoramidite用于熒光原位雜交 (FISH) 探針的原理分析
發(fā)布時(shí)間：2026-4-14·化學(xué)組成與概述
2'-O-甲基修飾：該單體核心為2'-O-甲基假尿苷（2'-OMe-pU），其2'-O-甲基化修飾可有效抑制核酸酶降解，顯著增強(qiáng)合成寡核苷酸的體內(nèi)外穩(wěn)定性。
假尿苷（pU）替代：采用假尿苷（pU）替代常規(guī)尿苷（U），可有效降低合成RNA的免疫原性，減少TLR等模式識(shí)別受體介導(dǎo)的炎癥反應(yīng)，提升體內(nèi)表達(dá)安全性與耐受性。
氰乙氧基（CE）保護(hù)基：引入CE作為5'-羥基保護(hù)基，相比傳統(tǒng)DMT（二甲氧基三苯甲基）保護(hù)基，具有脫保護(hù)速率快、副反應(yīng)少的特點(diǎn)。在固相合成中，可縮短脫保護(hù)時(shí)間、提升偶聯(lián)效率，減少酸降解與堿基脫嘌呤風(fēng)險(xiǎn)，最終提高全長(zhǎng)寡核苷酸的收率與純度。
·基本性能參數(shù)
CAS號(hào)：199737-09-2
中文名稱：2'-O-甲基假尿苷-CE-亞磷酰胺
英文名稱：2'-OMe-pU-CE-Phosphoramidite
別稱：2'-O-Methyl-5'-O-DMT-pseudouridine 3'-CE phosphoramidite；DMTr-2'-O-Me-pseudoU-3'-CE-phosphoramidite
分子式：C40H49N4O9P
分子量：760.81
外觀：白色至類白色粉末或結(jié)晶
溶解性：易溶于乙腈、DCM、吡啶等有機(jī)溶劑，建議用無(wú)水乙腈配制合成溶液
純度：95%+
供應(yīng)商：西安凱新生物科技有限公司
結(jié)構(gòu)式：
安全性：
操作時(shí)需佩戴防護(hù)裝備，避免接觸皮膚和眼睛。
如不慎接觸，請(qǐng)立即用大量清水沖洗，并尋求醫(yī)療幫助。
2'-OMe-pU-CE-Phosphoramidite用于熒光原位雜交 (FISH) 探針的優(yōu)勢(shì)是什么？其原理是什么？
一、核心優(yōu)勢(shì)
優(yōu)良的核酸酶抗性：2'-OMe修飾能有效抵抗RNase H及其他核糖核酸酶的降解，在細(xì)胞裂解液或組織勻漿中保持完整性，延長(zhǎng)探針的半衰期，提高檢測(cè)靈敏度。
低免疫原性：相比未修飾RNA或2'-F修飾探針，2'-OMe修飾不易被Toll樣受體（TLR3/7/8）識(shí)別，減少對(duì)樣本的免疫干擾，特別適合活細(xì)胞或原代組織的FISH實(shí)驗(yàn)。
信號(hào)放大潛力：與鎖核酸（LNA）相比，2'-OMe探針與RNA結(jié)合后不被RNase H切割，可在HCR（雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）或bDNA（分支DNA）等信號(hào)放大系統(tǒng)中作為穩(wěn)定的捕獲探針。
二、作用原理
2'-OMe-pU-CE-Phosphoramidite作為亞磷酰胺單體，通過(guò)固相合成摻入FISH探針序列。其核糖2'位上的甲氧基（-OCH?）通過(guò)空間位阻效應(yīng)，強(qiáng)制糖環(huán)采取N構(gòu)型（3'-內(nèi)式），使探針預(yù)組織成類似A型雙螺旋的構(gòu)象。這種構(gòu)象與靶標(biāo)RNA的天然構(gòu)象互補(bǔ)，減少了結(jié)合過(guò)程中的熵?fù)p失，從而熱力學(xué)上增強(qiáng)了探針-靶標(biāo)雙鏈的穩(wěn)定性（ΔG更負(fù)）。同時(shí)，甲氧基的疏水作用排開(kāi)周?chē)肿?，進(jìn)一步穩(wěn)定雙鏈結(jié)構(gòu)。這一機(jī)制使2'-OMe探針在保持高特異性的同時(shí)，實(shí)現(xiàn)了更高效的RNA檢測(cè)。
·相關(guān)試劑
ProteOrange Protein Quantification Reagent, 500x
ProteOrange Protein Quantification Kit
ProteOrange Protein Gel Stain, 5000×
PKH2 cell membrane labeling kit
BDP 581/591 maleimide
BDP 630/650 tetrazine
CFDA SE cell tracing kit
?BDP 630/650 alkyne
DusQ 2 NHS ester
BDP TR methyl ester
Alkyne-PEG3-amine
BDP 581/591 amine
DiA, lipophilic tracer
Amine-PEG4-OH
DusQ 3 NHS ester
以上內(nèi)容均由西安凱新生物科技有限公司YNN編輯整理
該試劑僅用于科研實(shí)驗(yàn)，不可用于人體
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