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·化學(xué)組成與結(jié)構(gòu)

Cy5熒光染料：屬于花青素類近紅外熒光染料，激發(fā)波長約649 nm，發(fā)射波長約665-670 nm。其長波長特性可減少生物樣本自發(fā)熒光干擾，提高信噪比，適用于深層組織成像。

亞磷酰胺基團：作為活性反應(yīng)基團，磷原子上的氯原子可被親核試劑（如核酸的5'-羥基）取代，形成穩(wěn)定的磷酸三酯鍵，實現(xiàn)熒光標(biāo)記。

·基本性能參數(shù)

CAS號：182873-67-2

中文名稱：CY5-亞磷酰胺；花青素CY5 亞磷酰胺

英文名稱：Cy5-Phosphoramidite；Cyanine5 Phosphoramidite

分子式：C60H72ClN4O4P

分子量：979.66

外觀：綠色粉末

Ex (nm)：646

Em(nm) ：664

純度：≥95%

供應(yīng)商：西安凱新生物科技有限公司

結(jié)構(gòu)式：

儲存條件：-20℃以下冰凍、干燥保存，避免反復(fù)凍融

安全性：

操作時需佩戴防護(hù)裝備，避免接觸皮膚和眼睛。

如不慎接觸，請立即用大量清水沖洗，并尋求醫(yī)療幫助。

·標(biāo)記反應(yīng)機理

Cy5磷酰胺酯標(biāo)記核酸時，關(guān)鍵化學(xué)步驟是借助其磷酰胺基團與核酸羥基發(fā)生反應(yīng)，以此形成穩(wěn)定的磷酸二酯鍵。具體反應(yīng)機理如下：

活性位點識別

在寡核苷酸化學(xué)合成進(jìn)程中，寡核苷酸鏈末端（一般多為3’羥基）充當(dāng)親核試劑。

親核攻擊

Cy5磷酰胺酯里的磷酰胺磷原子帶正電性，易受到寡核苷酸末端羥基氧原子這一親核試劑的攻擊。

中間體形成

親核攻擊會形成過渡態(tài)中間體，之后通過離去基團（通常為二乙基氨基基團或類似活性基團）的脫離，實現(xiàn)磷酰胺酯向磷酸二酯的轉(zhuǎn)化。

共價結(jié)合形成

最終產(chǎn)物是穩(wěn)定的磷酸二酯鍵，Cy5染料成功連接到核酸鏈端，達(dá)成熒光標(biāo)記目的。

此反應(yīng)通常在自動化固相合成儀器內(nèi)開展，結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)的DNA/RNA合成周期，可確保標(biāo)記的精準(zhǔn)性與高效性。

·作用與應(yīng)用

Cy5亞磷酰胺是熒光化學(xué)試劑，能在寡核苷酸合成時將Cy5染料整合到DNA/RNA末端或特定位置。其標(biāo)記可用于熒光成像、FISH、定量PCR等實驗監(jiān)測核酸行為；借助熒光成像技術(shù)實現(xiàn)高靈敏度檢測，用于分子相互作用研究；常與Cy3等構(gòu)成FRET供體-受體對，檢測分子動態(tài)變化；配合相關(guān)技術(shù)可研究核酸-蛋白質(zhì)結(jié)合機制?？傊ρ芯咳藛T追蹤核酸行為、研究分子相互作用。

·相關(guān)試劑

Biotin-11-UTP

Pyrene maleimide

Cyanine5.5 azide

SynaptoProbe Green

Cyanine7.5 maleimide

BDP 630/650 lipid stain

Cyanine7 carboxylic acid

DusQ 2 phosphoramidite

sulfo-Cyanine5 hydrazide

FAM tetrazine, 6-isomer

TAMRA maleimide, 6-isomer

Universal CPG type II, 1000A

DOTA-PEG4-amine hydrochloride

Hexaethylene glycol phosphoramidite

以上內(nèi)容均由西安凱新生物科技有限公司YNN編輯整理

該試劑僅用于科研實驗，不可用于人體

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