Orbitrap高分辨質(zhì)譜的分辨率高，定性結(jié)果比低分辨質(zhì)譜儀更準(zhǔn)確，但是由于目前高分辨質(zhì)譜儀除了磁質(zhì)譜，其它類型儀器都是脈沖分析離子或者是掃描分析離子，因此定量不太準(zhǔn)確，所以在定量上低分辨的三重四級桿質(zhì)譜儀比較準(zhǔn)確。

 

　　Orbitrap高分辨質(zhì)譜可以在很寬的質(zhì)量范圍內(nèi)生成全掃描數(shù)據(jù)，同時提供組分的定性和定量分析。此外，在各種生物基質(zhì)（如血漿、血清，尿液等）中的藥物代謝物分析需要復(fù)雜的前處理過程，而Orbitrap質(zhì)譜對于復(fù)雜生物基質(zhì)中的痕量分析物也可進(jìn)行準(zhǔn)確的分析，從而簡化了樣品前處理過程。基于這些優(yōu)勢，Orbitrap質(zhì)譜已成為藥物代謝研究中強(qiáng)有力的分析工具

 

　　利用高分辨質(zhì)譜儀可以提供分子組成式。因?yàn)樘?、氫、氧、氮的原子量分別為12.000000、1.007825、15.994914、14.003074，如果能準(zhǔn)確測定化合物的分子量，可以由計算機(jī)輕而易舉地計算出所含不同元素的個數(shù)。目前傅里葉變換質(zhì)譜儀、雙聚焦質(zhì)譜儀、飛行時間質(zhì)譜儀等都能給出化合物的元素組成。

 

　　用低分辨質(zhì)譜測定時，分子的質(zhì)量數(shù)都是整數(shù)表示，如CO、N2、C2H4和CH2N的質(zhì)量都是28。如果用高分辨質(zhì)譜測定就能得到如C2H4＝28.031299，CH2N＝28.018723。

 

　　因此，根據(jù)高分辨質(zhì)譜所測得的質(zhì)量就可以對結(jié)構(gòu)加以剖析和區(qū)別，小分子化合物確定結(jié)構(gòu)式有多種方法，NMR，高分辨質(zhì)譜（由于每個元素的原子量實(shí)際都是小數(shù)的，通過高分辨質(zhì)譜可以直接獲得化學(xué)式。