Orbitrap高分辨質(zhì)譜儀可區(qū)分相同質(zhì)量數(shù)的不同離子。乙烯，氮氣和一氧化碳離子的質(zhì)量數(shù)同為28，但質(zhì)量虧損導(dǎo)致三者的準(zhǔn)確質(zhì)量有細(xì)微差異。儀器分辨率達(dá)到2300（半高峰寬）時，可以區(qū)分出乙烯，但氮氣和一氧化碳仍然不能區(qū)分；而當(dāng)采用更高的分辨率5000時，即可區(qū)分三者。

 

　　目前廣泛使用的用于蛋白質(zhì)鑒定的質(zhì)譜分析主要使用兩種類型質(zhì)譜：一種是MALDI－TOF直接對分子量進(jìn)行測量；另一種是使用ESI－MS高分辨率質(zhì)譜分析電噴霧得到的多電荷信號，然后對信號進(jìn)行去卷積分析，獲得準(zhǔn)確分子量數(shù)值。

 

　　普通質(zhì)譜和高分辨質(zhì)譜的區(qū)別，直觀一點可以說是：能夠?qū)y得離子質(zhì)量數(shù)，準(zhǔn)確到小數(shù)點后兩位和后六位的區(qū)別。高分辨質(zhì)譜能夠?qū)⒎肿恿肯嗖詈苄〉膬煞N物質(zhì)進(jìn)行區(qū)分，從而準(zhǔn)確推斷分子元素。厲害的高分辨質(zhì)譜甚至可以取代部分元素分析。

 

　　這兩種方法各有其優(yōu)點及適用的領(lǐng)域。同時配備了這兩種質(zhì)譜分析系統(tǒng)，可用于各類蛋白質(zhì)樣品分子量測定，滿足包括肽指紋圖譜分析及蛋白質(zhì)鑒定在內(nèi)的多種蛋白質(zhì)分子量分析需求。

 

　　進(jìn)入質(zhì)譜之前的反相色譜分離過程中連接了紫外檢測器，在實現(xiàn)對樣品分離的同時，還會對樣品的純度進(jìn)行評估；色譜分離的過程也降低了在準(zhǔn)確分子量檢測過程中對樣品純度的要求。

 

　　Orbitrap高分辨質(zhì)譜利用軟件對質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析時，可以根據(jù)TIC（總離子流圖）分別對樣品中的主要成分和次要成分的分子量進(jìn)行選擇和分析。然后對上述原始數(shù)據(jù)進(jìn)行去卷積處理，得到該蛋白樣品中主要成分的準(zhǔn)確分子質(zhì)量。