Orbitrap高分辨質(zhì)譜儀可區(qū)分相同質(zhì)量數(shù)的不同離子。乙烯，氮?dú)夂鸵谎趸茧x子的質(zhì)量數(shù)同為28，但質(zhì)量虧損導(dǎo)致三者的精確質(zhì)量有細(xì)微差異。儀器分辨率達(dá)到2300（半高峰寬）時(shí)，可以區(qū)分出乙烯，但氮?dú)夂鸵谎趸既匀徊荒軈^(qū)分；而當(dāng)采用更高的分辨率5000時(shí)，即可區(qū)分三者。

 

　　分辨率即是指質(zhì)譜儀區(qū)分兩個(gè)質(zhì)量相近（質(zhì)量差為）的離子的能力。近似說(shuō)來(lái)，分辨率是500，就是指能區(qū)分500和與其質(zhì)量數(shù)相差為1（即501/499）的離子。（更加具體地說(shuō)，這里的“區(qū)分"也是要嚴(yán)格定義的，通常有10%峰谷比和半高峰寬兩種定義。但是這兩種定義方法的結(jié)果通常是線性相關(guān)的，在此不詳細(xì)介紹和區(qū)分。

 

　　Orbitrap高分辨質(zhì)譜儀對(duì)原始信號(hào)進(jìn)行采集。然后使用軟件對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算，得到樣品精確分子量。進(jìn)入質(zhì)譜之前的反相色譜分離過(guò)程中連接了紫外檢測(cè)器，在實(shí)現(xiàn)對(duì)樣品分離的同時(shí)，還會(huì)對(duì)樣品的純度進(jìn)行評(píng)估；色譜分離的過(guò)程也降低了在精確分子量檢測(cè)過(guò)程中對(duì)樣品純度的要求。

 

　　利用軟件對(duì)質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析時(shí)，可以根據(jù)TIC（總離子流圖）分別對(duì)樣品中的主要成分和次要成分的分子量進(jìn)行選擇和分析。在進(jìn)行肽段精確分子量計(jì)算的過(guò)程中，我們只需要找到肽段洗脫時(shí)間點(diǎn)的質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)。

 

　　按照經(jīng)典的計(jì)算分子質(zhì)量的方法，同時(shí)對(duì)帶有兩個(gè)以上電荷的分子進(jìn)行分子量計(jì)算，得到該肽段樣品的精確分子質(zhì)量。質(zhì)譜質(zhì)量精確度只與校正時(shí)的質(zhì)量穩(wěn)定性、校正和與理論預(yù)測(cè)的符合程度情況有關(guān)。也就是說(shuō)其實(shí)與分辨率沒(méi)什么必然關(guān)系。