Orbitrap高分辨質(zhì)譜儀可區(qū)分相同質(zhì)量數(shù)的不同離子。乙烯，氮氣和一氧化碳離子的質(zhì)量數(shù)同為28，但質(zhì)量虧損導致三者的精確質(zhì)量有細微差異。儀器分辨率達到2300（半高峰寬）時，可以區(qū)分出乙烯，但氮氣和一氧化碳仍然不能區(qū)分；而當采用更高的分辨率5000時，即可區(qū)分三者。

 

　　分辨率即是指質(zhì)譜儀區(qū)分兩個質(zhì)量相近（質(zhì)量差為）的離子的能力。近似說來，分辨率是500，就是指能區(qū)分500和與其質(zhì)量數(shù)相差為1（即501/499）的離子。（更加具體地說，這里的“區(qū)分"也是要嚴格定義的，通常有10%峰谷比和半高峰寬兩種定義。但是這兩種定義方法的結(jié)果通常是線性相關(guān)的，在此不詳細介紹和區(qū)分。

 

　　Orbitrap高分辨質(zhì)譜儀對原始信號進行采集。然后使用軟件對原始數(shù)據(jù)進行計算，得到樣品精確分子量。進入質(zhì)譜之前的反相色譜分離過程中連接了紫外檢測器，在實現(xiàn)對樣品分離的同時，還會對樣品的純度進行評估；色譜分離的過程也降低了在精確分子量檢測過程中對樣品純度的要求。

 

　　利用軟件對質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)進行分析時，可以根據(jù)TIC（總離子流圖）分別對樣品中的主要成分和次要成分的分子量進行選擇和分析。在進行肽段精確分子量計算的過程中，我們只需要找到肽段洗脫時間點的質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)。

 

　　按照經(jīng)典的計算分子質(zhì)量的方法，同時對帶有兩個以上電荷的分子進行分子量計算，得到該肽段樣品的精確分子質(zhì)量。質(zhì)譜質(zhì)量精確度只與校正時的質(zhì)量穩(wěn)定性、校正和與理論預(yù)測的符合程度情況有關(guān)。也就是說其實與分辨率沒什么必然關(guān)系。