Neosuite MNPD 微生物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(Microbial Natural Products Database, NeoSuite)     

創(chuàng)騰科技有限公司和中國醫(yī)學*醫(yī)藥生物技術研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。MNPD 是基于*的化學信息管理系統(tǒng) ISIS/Base & Draw 構建的，在數(shù)據(jù)庫設計和數(shù)據(jù)采集上借鑒了多個已發(fā)布的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗，數(shù)據(jù)內(nèi)容涵蓋了近幾十年來主要相關文獻、專著中的微生物代謝物共 15000多個，其中有確切化學結構式的共 10000多個?；衔锏南嚓P信息包括來源，制備，理化性質(zhì)，化學結構，生物活性以及原始文獻等數(shù)據(jù)。MNPD 可以為從事藥物化學，微生物學，生物化學，藥理學，新藥篩選，天然產(chǎn)物研發(fā)，組合化學，化學信息學等領域的科研人員提供*的幫助，如天然產(chǎn)物的結構檢索，虛擬藥物篩選，構效關系研究，作為組合化學的初始結構等。

1、簡介
Neosuite MNPD 微生物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(Microbial Natural Products Database，MNPD)是創(chuàng)騰科技有限公司和中國醫(yī)學*醫(yī)藥生物技術研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。MNPD 是基于*的化學信息管理系統(tǒng) ISIS/Base & Draw 構建的，在數(shù)據(jù)庫設計和數(shù)據(jù)采集上借鑒了多個已發(fā)布的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗，數(shù)據(jù)內(nèi)容涵蓋了微生物天然產(chǎn)物的來源、制備、理化性質(zhì)、化學結構、生物活性以及原始文獻等各方面信息，形成了數(shù)據(jù)全面、可滿足多種功能需求的綜合性的化學信息數(shù)據(jù)庫。

2、數(shù)據(jù)庫特性
首先，占 80%*的 MDL ISIS 化學信息管理系統(tǒng)擁有其*的優(yōu)勢，能夠方便的建立、管理和檢索化學信息數(shù)據(jù)庫，并且可以利用通用接口十分方便的與其他系統(tǒng)如 Accelrys 和 Tripos 公司提供的分子模擬及分子設計軟件配合使用。使用者無需計算機專業(yè)知識，只需進行簡單培訓即可對數(shù)據(jù)庫進行檢索、瀏覽和維護。另外，據(jù)不*統(tǒng)計，迄今已從各種微生物發(fā)酵產(chǎn)物中分離得到 20000多種代謝產(chǎn)物純品，其中具有生物活性的代謝產(chǎn)物達 16000多種。而 MNPD 收集了近幾十年來主要相關專業(yè)文獻、專著中的微生物代謝產(chǎn)物共 15000多個，其中有確切化學結構式的共 10000多個。這些多樣性的結構*覆蓋了附表中所列出的所有微生物次級代謝產(chǎn)物的類別。

3、數(shù)據(jù)庫內(nèi)容
MNPD 收集的信息包括以下各個方面的內(nèi)容：
• 基本信息：微生物天然產(chǎn)物的俗名、別名、IUPAC命名、分子式、分子量、化合類型、CAS登記號等
• 物化性質(zhì)和譜圖信息：微生物天然產(chǎn)物的顏色、晶型、熔點、旋光度、溶解性、紫外和紅外特征吸收峰等
• 結構信息：已確定的微生物天然產(chǎn)物的二維分子結構式及利用分子力學方法優(yōu)化得到的三維分子結構
• 來源和生物活性：微生物產(chǎn)物的產(chǎn)生菌、制備方法及生物活性測試結果
• 原始參考文獻及zhuan'li信息

4、應用前景

MNPD 可以為從事藥物化學、微生物學、生物化學、藥理學、新藥篩選、天然產(chǎn)物研發(fā)、藥物設計、組合化學、化學信息學等領域的科研人員提供*的幫助，例如：

• 微生物天然產(chǎn)物的檢索、查新和排重。對每項內(nèi)容均可進行精確或模糊查詢，可利用 Query Builder 任意組合字段構建聯(lián)合查詢式，提供*的二維和三維分子結構或子結構查詢功能

• 微生物天然產(chǎn)物的主要來源、化學結構類型、各種生物活性種類的總結性檢索

• 與藥物設計軟件和計算化學軟件結合，利用微生物天然產(chǎn)物的三維結構進行藥物分子設計和藥物虛擬篩選研究

• 對微生物天然產(chǎn)物的結構及活性信息進行定量或定性的分析，研究某類產(chǎn)物的構效關系，為新藥研究提供系統(tǒng)和有價值的信息

• 由于微生物天然產(chǎn)物的結構多樣性，可為組合化學和組合生物學提供有價值的起始結構和微生物產(chǎn)生菌信息