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實施效果

來源：計算模擬平臺

通過Discovery Studio軟件設計指導了變構肽配體（Altered peptide ligands，APLs）用于治療I型糖尿病。

方案詳情

I型糖尿病在人類和非肥胖糖尿病小鼠中均是一種自身免疫系統(tǒng)缺陷的疾病，有研究表明其主要由于CD8+ T細胞介導的β細胞損傷，使之不能正常分泌胰島素。變構肽配體（Altered peptide ligands，APLs）可以有效抑制抗原-特異性T細胞失效，凋亡或轉移。因此開發(fā)有效的APLs用于I型糖尿病的治療很有必要。本文通過分子模擬技術對變構肽配體進行了設計和優(yōu)化。

文章作者基于已知的變構肽配體與受體的復合物結構，首先通過Discovery Studio突變了復合物結構中的關鍵氨基酸殘基，確定了變構肽的關鍵改造位置，并設計了8個變構肽配體。然后結合DS_Loop refinement和分子動力學程序Standard Dynamics Cascade對8個變構肽配體的復合物進行了結構模擬和優(yōu)化，并基于MM-PBSA方法預測了它們與受體之間的結合能，根據(jù)預測結果（表1）選擇其中四個肽進行了合成和生物活性測試，其中變構肽H6F活性較好。針對H6F進行了后續(xù)的試驗研究，試驗結果表明變構肽配體H6F有希望成為一個治療I類糖尿病的藥物。