海藻糖有3種光學異構體，分別是α，α-海藻糖（蘑菇糖，Mushroom Sugar）、α，β-海藻糖（新海藻糖，Neotrehalose）和β，β-海藻糖（異海藻糖，Isotrehalose）。其中只有α，α-海藻糖在自然界中以游離狀態(tài)存在，即為通常所說的海藻糖，廣泛存在于各種生物體中，包括細菌、酵母、真菌和藻類以及一些昆蟲、無脊椎動物和植物中，尤其在酵母中含量較多，面包和啤酒等發(fā)酵食品及蝦類等也含有海藻糖。α，β-型和β，β-型在自然界中很少見，僅在蜂蜜和蜂王漿中發(fā)現(xiàn)了少量的α，β-型海藻糖，α，β-型和β，β-型這兩種海藻糖可以化學合成。 

海藻糖為體內(nèi)有益腸道細菌--雙歧桿菌的增殖因子，可改善腸道微生態(tài)環(huán)境，加強胃腸道消化吸收功能，有效排除體內(nèi)毒素，增強機體免疫抗病能力，研究還證明海藻糖具有較強的抗輻射作用。