純化水系統作為GMP認證的關鍵系統，在整個認證過程中有著*的意義。二級反滲透、一級反滲透+EDI、二級反滲透+EDI的核心工藝已廣泛用于藥廠的純化水制取。

純化水設備：預處理系統（包括多介質過濾器、活性炭過濾器和軟化器）、純化水的制水系統：二級反滲透、一級反滲透+EDI、二級反滲透+EDI系統）、純化水分配系統、巴氏消毒和CIP消毒系統及控制系統（全自動化控制系統和自動控制系統）組成。

設備采用PLC控制，觸摸屏顯示設備工藝流程、電導率、PH值、液位、流量流速，同時可以在觸摸屏上實現手動和全自動操作。

在整套系統中一級、二級反滲透和EDI產水后設有不合格回流裝置，當產水電導率符合設定值時產水進入下一道處理程序，不符合設定值時產水返回至前一道處理程序重新進行處理。當純水箱滿時設備會全自動進入小循環(huán)系統。

全套系統具有高、低壓警報、水箱缺水警報、故障警報、壓縮空氣低警報、電導率不符合要求警報功能。三級控制系統、對產水電導率有儲存功能并有USB打印機接口，從而實施全自動控制和操作。實現原水泵輸送泵變頻控制。還配有無紙記錄儀、即時打印。