硝酸舍他康唑對真菌細胞壁有兩種主要的影響。一方面，同其他咪唑類抗真菌藥一樣，硝酸舍他康唑通過抑制真菌細胞壁麥角固醇的合成而產(chǎn)生抗真菌作用。另一方面，它結構中加入了*的親脂性苯并噻吩環(huán)結構，提高了其皮膚角質(zhì)層的穿透能力，而沒有系統(tǒng)吸收，該結構與色氨酸中的吲哚環(huán)相似，利用真菌對色氨酸的需要，硝酸舍他康唑可以置換色氨酸，導致真菌細胞膜上出現(xiàn)通道和微孔，影響真菌細胞膜通透性。二者共同作用的結果使得細胞內(nèi)物質(zhì)泄露，如三磷酸腺苷及其他對真菌存活非常重要的物質(zhì)大量流失，迅速引起真菌細胞死亡。