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耶魯大學的一個研究小組，通過分析大腸桿菌和Linux系統(tǒng)的控制網(wǎng)絡，試圖找出為什么有機生命體和計算機操作系統(tǒng)，一個一般運行平穩(wěn)，一個卻會崩潰。生物醫(yī)學信息教授說有一個司空見慣的比喻：基因組實際就是一個生物體的操作系統(tǒng)。我們想看看這個比喻是不是符合實際。

大腸桿菌和Linux網(wǎng)絡都是層級結構，但在運轉(zhuǎn)效率方面有顯著的差異。細菌的分子網(wǎng)絡排列成金字塔形狀，塔尖少部分的主調(diào)控基因獨立行事，控制著塔基廣泛的基礎功能。

相比之下，Linux操作系統(tǒng)更像一個倒置的金字塔，由許多頂層線程控制少量底層功能。Gerstein說，這個架構的產(chǎn)生是由于軟件工程師為節(jié)省資金和時間傾向于依靠現(xiàn)有資源，而不是從頭開始。

Gerstein說，這也意味著操作系統(tǒng)更容易受到損壞，因為也許只是更新一個普通的組件，都具有破壞性，為了彌補缺陷，設計師必須對這些通用的組件進行不斷地調(diào)整。

操作系統(tǒng)就像城市街道――工程師的目光集中于車流量很大的區(qū)域，但如果對大腸桿菌這樣的生命體，情形就不一樣了。因為沒有微調(diào)，一個隨機突變對主要分子通道的破壞將是致命的。這就是為什么大腸桿菌沒有基礎通用組件，卻有高度專業(yè)化的模塊組織的原因。在幾十億年的進化過程中，已經(jīng)證明了這樣一個健全的組織，可以保護機體免遭隨機突變破壞。