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中科院杰青研究組文章解析DNA分析新方法

發(fā)布時間:2011-4-6

來自中科院動物研究所,武漢大學(xué)的研究人員建立了一個測定Kf的等溫差異雜交方法,為了解生理條件下G-四重折疊形成提供一個有用的工具。這一研究成果公布在Anal. Chem.雜志上。

  領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是動物研究所譚錚研究員,這位研究人員回國后曾在華南理工大學(xué),武漢大學(xué)等多處任職,2005年加入中科院動物研究所,曾獲得國家杰出青年科學(xué)基金,入選*"百人計劃"國外引進杰出人才,其課題組主要研究方向是衰老的分子生物學(xué)研究。

  人端粒DNA和其他很多富鳥嘌呤(G)序列能形成一類稱作鳥嘌呤-四重折疊(G-quadruplex)的DNA四重折疊結(jié)構(gòu)。這種結(jié)構(gòu)與很多生物學(xué)過程、治療癌癥以及分子機器有關(guān)。折疊平衡常數(shù)Kf是衡量G-四重折疊形成能力的定量描述。生理條件下的G-四重折疊結(jié)構(gòu)不是獨立存在,而是伴有旁側(cè)結(jié)構(gòu)或與蛋白結(jié)合。然而現(xiàn)有的Kf測定方法只能用于核心序列。

  在這篇文章中,譚錚研究組建立了一個測定Kf的等溫差異雜交方法,不僅能用于核心序列,同時適用于伴有旁側(cè)結(jié)構(gòu)或結(jié)合蛋白存在的情況這一方法將為了解生理條件下G-四重折疊形成提供一個有用的工具。

  近期有關(guān)DNA研究也獲得了許多重要成果,讓人印象深刻的就是來自愛荷華大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)當(dāng)一種特殊的DNA重復(fù)片段——Alu元件插入到基因中,可以改變蛋白質(zhì)生成的速率,從而導(dǎo)致了不同物種中不同生物學(xué)特性的進化。

  Alu元件大約是在6000萬年前隨靈長動物的進化而出現(xiàn)的一種特殊的DNA重復(fù)序列。其他的哺乳動物基因組中不存在有Alu元件。在人類基因組中Alu元件是zui常見的一種可移動DNA,并能夠跳躍至基因組序列的其他位置。當(dāng)他們插入到包含基因區(qū)域時,這些元件有可能轉(zhuǎn)變?yōu)樾峦怙@子。盡管在十幾年前科學(xué)家們就明確Alu元件是人類基因組中新外顯子的重要來源,但是一直也無法確定這些新外顯子是否真正具有重要的生物功能。

  這篇文章利用高通量RNA測序新技術(shù)分析了來自人類小腦的1.2億個RNA序列,進而對Alu衍生的外顯子插入成熟RNA序列中的頻率進行了定量,并由此確定了它們在基因中的插入位置以及zui終蛋白質(zhì)生成的藍圖。


 

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