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（一）   原料與工藝差異
顧名思義，大豆磷脂為提取自大豆，是植物來(lái)源；蛋黃磷脂是提取自雞蛋黃，動(dòng)物來(lái)源。
蛋黃磷脂的生產(chǎn)原料為蛋黃粉，提取方法為有機(jī)溶劑提純法和超臨界CO2萃取法。原材料成本高，生產(chǎn)工藝復(fù)雜，生產(chǎn)成本也較高。
大豆磷脂的生產(chǎn)工藝相對(duì)簡(jiǎn)單。但是，目前，大多食用、藥用卵磷脂的生產(chǎn)原料均為大豆油副產(chǎn)品大豆腳油。由于材料來(lái)源廣泛，生產(chǎn)工藝簡(jiǎn)單，價(jià)格低廉。

（二）   脂肪酸構(gòu)成差異
表1. 蛋黃卵磷脂與大豆卵磷脂的脂肪酸組成

脂肪酸	蛋黃卵磷脂	大豆卵磷脂
內(nèi)豆蔻酸（ C14:0 ）	0.38	0.90
棕櫚酸（ C16:0 ）	26.27	15.35
棕櫚油酸（ C16:1 ）	2.80	0.11
十七碳酸（ C17:0 ）	0.32	-
十七碳酸 - 烯酸（ C14:1 ）	0.36	-
硬脂酸（ C18:0 ）	9.17	-
油酸（ C18:1 ）	41.50	17.86
亞油酸（ C18:2 ）	16.24	54.84
亞麻酸（ C18:3 ）	0.30	6.31
花生四烯酸（ C20:4 ）	1.73	-
二十二碳四烯酸（ C20:6 ）	0.53	-
二十二碳六烯酸（ C22:6 ）	0.51	-
其他	2.89	0.86

另外，蛋黃磷脂和大豆磷脂配位的脂肪酸不同：在蛋黃磷脂中R1幾乎是飽和脂肪酸，R2通常是不飽和脂肪酸，而大豆卵磷脂R1和R2是飽和酸和不飽和酸混合配位。蛋黃磷脂的脂肪酸組分大多為棕櫚酸、油酸，其次為硬脂酸、亞油酸，并且還含有微量花生四烯酸和二十二碳六烯酸等近年來(lái)備受關(guān)注的多不飽和脂肪酸及奇數(shù)碳脂肪酸（如十七烷酸）等；大豆磷脂中亞油酸約占50%，幾乎不含C20以上的脂肪酸。

（三）   磷脂類型差異
兩者所含磷脂組分有異。與大豆磷脂相比，蛋黃磷脂zui令人矚目的特點(diǎn)是，PC含量較高（可達(dá)到70%～80%），基本不含磷脂酰肌醇（PI）和磷脂酸（PA）。下表中給出了蛋黃和大豆中磷脂成分的比較。
蛋黃與大豆中磷脂成分含量的比較(%)

磷脂	蛋黃	大豆
磷脂酰膽堿 (PC)	73	30
磷脂酰乙醇胺 (PE)	15	22
磷脂酰肌醇 (PI)	1	18
磷脂酸 (PA)	-	2
絲氨酸磷脂 (PS)	-	3-4
神經(jīng)鞘磷脂	2-3	-
縮醛磷脂	1	-

（四）   穩(wěn)定性差異
由于不飽和度較蛋黃磷脂高，大豆磷脂的碘值偏高，因此更易受空氣、光照、溫度等因素的影響，發(fā)生氧化變性。所以，大豆磷脂的穩(wěn)定性以及作為藥用輔料的使用性能較蛋黃磷脂差。

（五）   批間穩(wěn)定性差異
大豆磷脂的批間穩(wěn)定性很難維持，這可能跟原料為大豆腳油有關(guān)。腳油是大豆油生產(chǎn)的副產(chǎn)品，因此很難保證質(zhì)量穩(wěn)定。而蛋黃粉是母雞蛋割蛋后分離蛋清，將蛋黃脫水的直接產(chǎn)品。