技術(shù)文章
擴(kuò)展的主要組織相容性復(fù)合體
發(fā)布時(shí)間:2012-6-9xMHC這段區(qū)域長(zhǎng)度從HLA工類(lèi)區(qū)域zui遠(yuǎn)端的HCP5P15算起,zui終擴(kuò)展到HLAⅡ類(lèi)區(qū)域的接近著絲粒處的KIFCI,共7.6Mb,包括下列5個(gè)亞區(qū)及421個(gè)基因座位。
(1)擴(kuò)展的I類(lèi)亞區(qū)(extendedclassⅠsubregion):長(zhǎng)3.9 M山含有182個(gè)基因座位。
(2)經(jīng)典的I類(lèi)亞區(qū)(classicalclassⅠsubregi。n):長(zhǎng)1.9 Mb,含有122個(gè)基因座位。
(3)經(jīng)典的Ⅲ類(lèi)亞區(qū)(claSSicalclassⅢsubregi。n):長(zhǎng)0.7 Mb,含有62個(gè)基因座位。
(4)經(jīng)典的Ⅱ類(lèi)亞區(qū)(classicalclassⅡsubregion):長(zhǎng)0.9 Mb,含有34個(gè)基因座位。
(5)擴(kuò)展的Ⅱ類(lèi)亞區(qū)(extendedclassⅡsubregion):長(zhǎng)0.2 Mb,含有21個(gè)基因座位。
所有基因可歸納為四種類(lèi)型:
①表達(dá)基因(expressedgene):此類(lèi)基因可轉(zhuǎn)錄成mRNA,有一個(gè)穩(wěn)定的開(kāi)放閱讀框(ORF)和已知蛋白產(chǎn)物。共252個(gè),占421個(gè)基因的59.9%。
②后選基因(gene candidate):此類(lèi)基因可轉(zhuǎn)錄成mRNA,有不明確的ORF,可有或無(wú)編碼蛋白質(zhì)的序列。
③非編碼基因(non-codinggene):此類(lèi)基因有mRNA,無(wú)任何ORF,也無(wú)蛋白產(chǎn)物表達(dá)。共30個(gè),占7.1%。
④假基因(pseudogene):此類(lèi)基因一般不能轉(zhuǎn)錄成mRNA,可能是一個(gè)基因結(jié)構(gòu)片段或是一個(gè)交換后(retrotransposed)和未處理的cDNA結(jié)構(gòu)。共139個(gè),占33.0%。
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