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技術(shù)文章

擴(kuò)展的主要組織相容性復(fù)合體

發(fā)布時間:2012-6-9

xMHC這段區(qū)域長度從HLA工類區(qū)域zui遠(yuǎn)端的HCP5P15算起,zui終擴(kuò)展到HLAⅡ類區(qū)域的接近著絲粒處的KIFCI,共7.6Mb,包括下列5個亞區(qū)及421個基因座位。

(1)擴(kuò)展的I類亞區(qū)(extendedclassⅠsubregion):長3.9 M山含有182個基因座位。
(2)經(jīng)典的I類亞區(qū)(classicalclassⅠsubregi。n):長1.9 Mb,含有122個基因座位。
(3)經(jīng)典的Ⅲ類亞區(qū)(claSSicalclassⅢsubregi。n):長0.7 Mb,含有62個基因座位。
(4)經(jīng)典的Ⅱ類亞區(qū)(classicalclassⅡsubregion):長0.9 Mb,含有34個基因座位。
(5)擴(kuò)展的Ⅱ類亞區(qū)(extendedclassⅡsubregion):長0.2 Mb,含有21個基因座位。

所有基因可歸納為四種類型:
①表達(dá)基因(expressedgene):此類基因可轉(zhuǎn)錄成mRNA,有一個穩(wěn)定的開放閱讀框(ORF)和已知蛋白產(chǎn)物。共252個,占421個基因的59.9%。
②后選基因(gene candidate):此類基因可轉(zhuǎn)錄成mRNA,有不明確的ORF,可有或無編碼蛋白質(zhì)的序列。
③非編碼基因(non-codinggene):此類基因有mRNA,無任何ORF,也無蛋白產(chǎn)物表達(dá)。共30個,占7.1%。
④假基因(pseudogene):此類基因一般不能轉(zhuǎn)錄成mRNA,可能是一個基因結(jié)構(gòu)片段或是一個交換后(retrotransposed)和未處理的cDNA結(jié)構(gòu)。共139個,占33.0%。

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