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HLA I類基因區(qū)位于復(fù)合體的zui遠(yuǎn)端，即從端粒端的HCP5p15到MICB之間，長度為1．9Mb，包括122個基因座位，其中41個為表達基因，12個為后選基因，3個為非編碼基因及66個假基因。根據(jù)編碼產(chǎn)物分布、功能及多態(tài)性不同又可分為經(jīng)典工類基因和非經(jīng)典I類基因。

（1）經(jīng)典HLA I類基因：又稱HLA-Ia，是指zui早發(fā)現(xiàn)的三個功能基因即HLA-A、HLA-月和HLA—C。HLA-Ia基因均具有高度多態(tài)性，如表4—l所示，截至2006年7月，HLA-月座位被正式命名的等位基因數(shù)已達805個，是整個HLA區(qū)域中等位基因數(shù)zui多的一個座位，也即多態(tài)性zui豐富的一個基因座位。每個等位基因均可分別編碼HLA I類分子重鏈（α鏈）。其輕鏈（β鏈）為β2m。

（2）非經(jīng)典HLA I類基因：又稱HLA-Ib，包括HLA-E、HLA-F、HLA-G三個座位。因其等位基因數(shù)的有限性、編碼產(chǎn)物分布的局限性以及功能*，而有別于經(jīng)典HLA-A、HLA-B、HLA-C基因。其中的HLA-E基因位于HLA-C和HLA-A座位之間，已正式命名有5個等位基因。HLA-F基因位于HLA-C基因外側(cè)。HLA-G基因位于HLA-A座位遠(yuǎn)側(cè)，被正式命名的等位基因已有23個。

（3）MIC基因：MIC（MHCclassl chain-related）基因是1994年發(fā)現(xiàn)的+個家族，目前有5個成員，分別命名為MICA、MICB、MICC、MICD和MICE。其中MICA和MICB為功能基因，余為假基因。MICA基因定位在HLA-B基因著絲粒方向40kb處，是HLA-B基因zui近的鄰居，且MICA具有高度多態(tài)性，等位基因數(shù)達61個，與HLA—B存在連鎖不平衡。

HLA I類區(qū)域內(nèi)數(shù)目zui多的是假基因，占54．1％（N＝66），如HLA-L、HLA-K、HLA—X等，其功能未明。