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本法綜合了SDS-PAGE的高分辨力和酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)（enzyme linked immunosorbentassay，ELISA）的高特異性和敏感性，是一個(gè)有效的分析手段，不僅廣泛應(yīng)用于分析抗原組分及其免疫活性，并可用于疾病的診斷。在艾滋病病毒感染中此法作為確診試驗(yàn)?？乖?jīng)電泳轉(zhuǎn)移在硝酸纖維素膜上后，將膜切成小條，配合酶標(biāo)抗體及顯色底物制成的試劑盒可方便地在實(shí)驗(yàn)室中供檢測(cè)用。根據(jù)出現(xiàn)顯色線條的位置可判斷有無(wú)針對(duì)病毒的特異性抗體。

目前，Western印跡法主要用于未知蛋白質(zhì)的檢測(cè)及抗原組分、抗原決定簇的分子生物學(xué)的測(cè)定；同時(shí)也可用于未知抗體的檢測(cè)和單克隆抗體的鑒定等。