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賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀

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更新時(shí)間:2022-03-03 18:16:46瀏覽次數(shù):1004次

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賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀:無需復(fù)雜的光路系統(tǒng), Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序技術(shù)利用天然核苷酸反應(yīng), 實(shí)現(xiàn)高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測(cè)靈敏度來探測(cè)低頻變異。

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀主要性能

• 無需復(fù)雜的光路系統(tǒng), Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序技術(shù)利用天然核苷酸反應(yīng), 實(shí)現(xiàn)高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測(cè)靈敏度來探測(cè)低頻變異。
• 相比市場(chǎng)上其他基于光學(xué)檢測(cè)技術(shù)的測(cè)序平臺(tái), IonS5系統(tǒng)幫助希望引入新一代測(cè)序技術(shù)的實(shí)驗(yàn)室降低初期投入成本。
• 支持多種不同價(jià)格和通量的半導(dǎo)體芯片(Ion 510™、Ion 520™、 Ion 530™和Ion 540™芯片), 從而為用戶開展各類DNA/RNA測(cè)序應(yīng)用項(xiàng)目提供更大的靈活性。
• 提供快的新一代測(cè)序儀運(yùn)行速度。
• 依托用戶與技術(shù)開發(fā)者社區(qū)-Ion社區(qū)(IonCommunity)-這一社區(qū)目前已擁有超過3萬(wàn)名會(huì)員,會(huì)員人數(shù)仍在每天增長(zhǎng)中。
• 較小的桌面占用空間, 僅需不到0.5平方米 (儀器尺寸:54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
• 提供廣泛的文庫(kù)制備方案與試劑盒選擇, 操作簡(jiǎn)單、快速, 起始樣品需求量極低, 適用于微生物測(cè)序、靶向基因測(cè)序、 外顯子組測(cè)序, 以及RNA測(cè)序等廣泛研究應(yīng)用。
• 與Ion Chef™系統(tǒng)或Ion OneTouch™ 2系統(tǒng)配合使用, 實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)易快速的模板制備。
• 通過整合的T630服務(wù)器與Torrent Suite™軟件, 實(shí)現(xiàn)從堿基識(shí)別到變異解析的完整解決方案。
• 運(yùn)用Ion Reporter™軟件對(duì)配對(duì)樣品DNA變異的檢測(cè)和分析, 提供簡(jiǎn)易和整合的三級(jí)數(shù)據(jù)分析工具。

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀技術(shù)參數(shù)與應(yīng)用

 

性能描述
簡(jiǎn)捷的靶向測(cè)序流程"簡(jiǎn)單、 快速的自動(dòng)化工作流程: 靶向測(cè)序應(yīng)用中, 從DNA樣品輸入到獲
得分析數(shù)據(jù)*的完整過程中手工操作不到45分鐘"

• 文庫(kù)制備:
– Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒: 15分鐘(手工操作時(shí)間)
– 使用AB Library Builder實(shí)驗(yàn)方案實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化文庫(kù)制備(13份樣品): 10分鐘(手工操作時(shí)間)
– Ion AmpliSeq靶向富集和建庫(kù)技術(shù):
  • 手動(dòng)建庫(kù)方案: 60分鐘(手工操作時(shí)間)
  • Ion Chef系統(tǒng)自動(dòng)化建庫(kù)方案: 15分鐘(手工操作時(shí)間)
• 模板制備:
– Ion OneTouch 2系統(tǒng): 模板擴(kuò)增, 手工操作時(shí)間2.5小時(shí)
– Ion Chef系統(tǒng): 模板擴(kuò)增與芯片上樣, 手工操作時(shí)間15分鐘
• 測(cè)序:
– 手工操作時(shí)間少于15分鐘
• 數(shù)據(jù)分析:
– 從5百萬(wàn)讀值數(shù)據(jù)(200 bp測(cè)序反應(yīng))獲得比對(duì)好的BAM文件, 操作時(shí)間不到5小時(shí)"
快速的新一代測(cè)序從DNA樣品到獲得變異結(jié)果快僅需兩個(gè)工作日(8小時(shí)計(jì)算)

• 測(cè)序反應(yīng)僅需2.5-4小時(shí)即可完成


• 使用Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒時(shí), 基因組DNA與擴(kuò)增文庫(kù)制備僅需2.5小時(shí); 使用Ion AmpliSeq靶向富集技術(shù)時(shí), 僅需3.5個(gè)小時(shí)
• 在Ion Chef系統(tǒng)上, 自動(dòng)對(duì)兩塊Ion S5芯片進(jìn)行模板制備與芯片上樣
• 在Ion S5 Torrent服務(wù)器上進(jìn)行數(shù)據(jù)分析, 數(shù)小時(shí)之內(nèi)完成變異檢測(cè)報(bào)告

高度靈活的通量四款芯片分別提供從2百萬(wàn)至8千萬(wàn)的序列通量, 用戶可以根據(jù)需求靈活選擇

每周樣品通量高每周可完成更多數(shù)量樣品的完整靶向測(cè)序工作流程

• 模塊化工作流程設(shè)計(jì), 支持用戶每周(5個(gè)工作日)進(jìn)行多次測(cè)序*: 每臺(tái)Ion S5系統(tǒng)每周可完成多達(dá)10次測(cè)序(200堿基讀值)
• 模塊化工作流程, 研究人員能夠在一臺(tái)Ion S5系統(tǒng)上多可同時(shí)操作384份標(biāo)記樣品, 每周多可檢測(cè)3840份獨(dú)立DNA樣品
* 工作日以8小時(shí)計(jì)算。
簡(jiǎn)捷、 直觀的系統(tǒng)盒裝試劑與友好的用戶界面, 為用戶提供一個(gè)簡(jiǎn)捷的測(cè)序流程

• 在Ion Chef系統(tǒng)、 Ion OneTouch 2系統(tǒng)和Ion S5系統(tǒng)上, 用戶可使用直觀的觸摸界面進(jìn)行編程和操控
• 用戶可通過固定或移動(dòng)設(shè)備(如iOS和Android設(shè)備)遠(yuǎn)程監(jiān)控Ion S5測(cè)序儀
• 行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF), 兼容第三方生物信息學(xué)軟件提供的下游分析和可視化工具。
• 模塊化工作流程, 可在文庫(kù)制備到測(cè)序的每一個(gè)環(huán)節(jié)中實(shí)施質(zhì)量控制, 幫助用戶節(jié)約時(shí)間, 降低試劑成本。
• 通過盒裝試劑與完整樣品跟蹤功能(RFID掃描)優(yōu)化流程, 提高效率
長(zhǎng)堿基讀長(zhǎng)• 200-、 400-與600-堿基讀長(zhǎng)
• 兼容長(zhǎng)mate-pair讀長(zhǎng)
*硬件牢固而簡(jiǎn)潔的硬件值得您信賴

• 設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單, 無冗余的活動(dòng)零件或復(fù)雜的附屬系統(tǒng), 穩(wěn)健可靠
• 標(biāo)準(zhǔn)臺(tái)式系統(tǒng)(Ion S5系統(tǒng)與Ion Chef系統(tǒng)或Ion OneTouch 2系統(tǒng)), 提供完整擴(kuò)增與測(cè)序工作流程
• 用戶可通過Ion S5系統(tǒng)的外置條碼閱讀器追溯芯片和樣品, 通過Ion S5 Torrent服務(wù)器實(shí)現(xiàn)樣品登記
• Ion Chef系統(tǒng)與Ion S5系統(tǒng)采用了優(yōu)的識(shí)別系統(tǒng), 對(duì)編碼耗材進(jìn)行識(shí)別和追蹤, 并將信息集成至Torrent Suite軟件和/或LIMS系統(tǒng)
• 所有Ion S5系統(tǒng)均由符合ISO 13485標(biāo)準(zhǔn)的工廠生產(chǎn)
緊湊型臺(tái)式系統(tǒng)Ion S5 XL系統(tǒng)僅占用很小的桌面空間

• 尺寸(W x D x L) (近似值): 21.4 x 31.75 x 20 in. (54.2 x 80.6 x 50.9 cm)
• 占用面積: 4.72 平方英尺
• 重量(近似值): 140 lb/63.5 kg
提供完整產(chǎn)品組合高性價(jià)比的新一代測(cè)序平臺(tái), 廣泛適用于各類DNA與RNA研究應(yīng)用
低序列偏性高度均一的覆蓋度及精確的變異檢測(cè)

• Ion 510/520/530 Kit-Chef與Ion 520/530 Kit-OT2能夠?qū)?00和400堿基文庫(kù)進(jìn)行精確、 可靠的測(cè)序
• Ion 540 Kit-Chef與Ion 540 Kit-OT2能夠?qū)?00堿基文庫(kù)進(jìn)行精確、 可靠的測(cè)序
• Ion 520/530 ExT Kit-Chef能夠?qū)?00堿基文庫(kù)進(jìn)行精確、 可靠的測(cè)序
• 通過簡(jiǎn)單的天然化學(xué)反應(yīng)過程獲得均一的覆蓋度(即無偏性)
• 基于天然核苷酸, 聚合酶或核苷酸上無附著的熒光基團(tuán), 從而實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)堿基讀長(zhǎng)和堿基識(shí)別的高保真度

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